科学大数据工程优秀数据成果专题 II 区论文(已发表) 版本 ZH3 Vol 8 (3) 2023
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2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区数据集
A dataset of paddy rice planting areas along the Yangtze River (Jiangsu section) in 2020
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: 2021 - 12 - 31
: 2022 - 09 - 16
: 2022 - 01 - 17
: 2023 - 09 - 08
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摘要&关键词
摘要:水稻是中国主要粮食作物,同时也是种植面积最广的作物之一。长江沿岸水资源充沛,水稻种植具有一定优势,及时准确地监测水稻种植信息,可为保障我国粮食安全提供重要技术支撑。目前基于遥感技术提取长江沿岸水稻种植区的研究较少,本文选取2020年覆盖长江沿岸水稻生长期(5–9月)的Sentinel-2卫星影像,依据水稻生长物候信息,利用高空间分辨率影像结合实地勘测,得到孟河镇水稻种植区真实分布图,并从中选取训练样本与验证样本。基于最大似然、神经网络、SVM(Support Vector Machine,支持向量机)等多种机器学习方法进行水稻提取研究,对比分析NDVI(Normalized Difference Vegetation Index,归一化植被指数)、REP(Red Edge Position Index,红边位置指数)光谱指数集的提取结果精度。结果表明,基于5、8、9月的3个时相REP指数集,结合经神经网络分类器,提取效果最佳,其提取结果总体精度为92.73%,Kappa系数为0.72。通过优选水稻提取的关键时相、光谱特征组合和分类器进行全局应用,并针对结果进行分类后处理,进而得到2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区矢量数据集,数据集总体分类精度为87.15%。本数据集可为进一步监测长江沿岸地区水稻种植范围与提升粮食估产精度提供参考依据。
关键词:长江沿岸;Sentinel-2;REP;NDVI;水稻提取
Abstract & Keywords
Abstract: As a staple food crop in China, paddy rice is one of the most widely grown crops in the country. Thanks to its abundant water resources, the Yangtze River has superiority in paddy rice planting. The prompt and accurate monitoring of paddy rice planting information plays an important role in providing essential technical support to safeguard China's food security. However, there is a scarcity of studies on the extraction of paddy rice planting areas along the Yangtze River using the remote sensing technology. In this paper, guided by paddy rice growth phenology information, we selected the Sentinel-2 satellite imagery that covered the paddy rice growing period (from May to September) along the Yangtze River in 2020. On the basis of high-spatial resolution images combined with field investigation, we obtained the real distribution map of the paddy rice planting area in Menghe Town and selected samples and validation samples from the map. Based on the maximum likelihood, neural network, SVM (Support Vector Machine) and other machine learning methods, we carried out the paddy rice extraction research, compared and analyzed the accuracy of extraction results of NDVI (Normalized Difference Vegetation Index) and REP (Red Edge Position Index) spectral index sets. The results show that the REP index sets of the three time phases in May, August and September are most effectively extracted using the neural network method. The overall accuracy of the results is 92.73%, with a corresponding Kappa coefficient of 0.72. We achieved global applicability by optimizing key parameters such as timing, spectral bands, and classifier methods for paddy rice extraction. Additionally, we conducted post-processing to refine the results. Finally, we obtained a vector dataset of paddy rice growing areas along the Yangtze River (Jiangsu section) in 2020, with an overall classification accuracy of 87.15%. This dataset is expected to provide a reference for further monitoring the paddy rice planting areas and enhancing the accuracy of grain production estimates throughout the Yangtze River region.
Keywords: Yangtze River; Sentinel-2; REP; NDVI; paddy rice extraction
数据库(集)基本信息简介
数据库(集)名称2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区数据集
数据作者徐慧、米晓飞、曹维佳、牟晓莉
数据作者曹维佳(caowj@aircas.ac.cn)
数据时间范围2020年
地理区域地理范围为31°30′18.66″–32°31′9.6″ N,119°7′43.9″–120°15′40.42″ E
数据量139 MB
数据格式*.shp
数据服务系统网址https://doi.org/10.11922/sciencedb.j00001.00350
基金项目国家对地观测科学数据中心开放基金项目(NODAOP2021011)
数据库(集)组成数据集为矢量数据集,包含10个文件,其中:2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区矢量.shp文件为水稻种植区空间分布矢量主文件,*.shx为索引文件,*.dfb为数据库文件,其余文件均为附属文件。
Dataset Profile
TitleA dataset of paddy rice planting areas along the Yangtze River (Jiangsu Section) in 2020
Data authorsCAO Weijia (caowj@aircas.ac.cn)
Datacorresponding authorXU Hui, MI Xiaofei, CAO Weijia, MOU Xiaoli
Time range2020
Geographical scope31°30′18.66″–32°31′9.6″N,119°7′43.9″–120°15′40.42″E
Data volume139 MB
Data format.shp
Data service system<https://doi.org/10.11922/sciencedb.j00001.00350>
Sources of fundingOpen Fund Project of National Earth Observation Scientific Data Center (NODAOP2021011)
DatasetcompositionThis is a vector dataset of 10 file. The vector of paddy rice planting areas along the Yangtze River (Jiangsu section) in 2020.shp” is the main file; “*.shx” is the index file; “*.dbf” is the database file, and the rest are subsidiary files.
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引 言
水稻作为全球一半人口的主食,及时、准确地提取水稻种植面积,可以为政府、规划者和决策者制定政策提供有价值的信息[1];水稻农业种植同时也涉及其他环境问题,包括水资源、气候变化(温室效应)和疾病传播等[2]。因此,水稻种植区提取对于了解和评估区域、国家和全球各级粮食安全、环境安全等具有重要意义。
传统水稻面积统计方式主要基于现场调查核验种植情况,并对稻田进行面积量算[3],该方法需要大量人力,且耗时较长[4-5]。遥感技术凭借其经济性、实时性、大面积同步观测等优势,被广泛地应用于各个行业。近年来随着科学技术的日益精进,遥感技术飞速发展,基于遥感手段提取水稻种植面积被证明是有效便捷的方法之一[3,6-10]
目前利用遥感手段提取水稻种植区的相关研究主要分为三类:(1)光学遥感;(2)微波遥感;(3)光学遥感与微波遥感结合。基于遥感手段提取的江苏省水稻种植区研究主要集中在2020年以前[11-12],难以满足近年的水稻种植区分布信息获取需求。因此,开展2020年及后续的水稻种植区提取研究对于及时了解水稻种植情况具有重要意义。本数据集针对2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区域,选取2020年5–9月长时间序列的Sentinel-2数据,计算NDVI、REP指数,形成多时相指数数据集;基于高分系列卫星遥感数据、北京二号卫星遥感数据结合实地勘测,获取试验区水稻种植区真实图;从中选取训练样本和验证样本,利用机器学习算法与传统分类法先进行试验区水稻种植区提取;并评定分类精度,进一步优选分类数据集及分类器;随后进行大区域分类应用,最终预测2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区分布情况,为区域相关部门提供2020年水稻种植区分布信息。
1   数据采集和处理方法
数据采集和处理包括遥感数据和实测数据的获取以及数据的相关处理,其中数据处理包括数据预处理与指数计算、数据集与分类器优选、全局应用三个部分。遥感提取长江沿岸(江苏段)水稻种植区数据集具体流程如图1所示。


图1   水稻种植区提取流程图
Figure 1 Flow chart of paddy rice planting area extraction
1.1   数据获取
数据来源于江苏天汇空间信息研究院有限公司——天汇景数据服务平台[13](https://scene.thxpace.com/imageN/#/search),利用该平台针对2020年4–12月长江沿岸(江苏段)(图2)的高分系列(高分一号、高分二号、高分六号)、北京二号、Sentinel-2影像进行搜索下载。


图2   研究区范围
Figure 2 Study area
其中,高分一号卫星于2013年4月26日成功发射,搭载了两台高分相机,每台相机包含2 m分辨率全色和8 m分辨率多光谱,四台16 m分辨率多光谱宽幅相机;高分二号卫星于2014年8月19日成功发射,是我国自主研制的首颗空间分辨率优于1 m的民用光学遥感卫星,搭载有两台高分辨率1 m全色、4 m多光谱相机实现拼幅成像;高分六号卫星于2018年6月2日成功发射,主要应用于精准农业观测、林业资源调查等行业,实现了8谱段探测器的国产化研制,是国内首次增加能够有效反映作物特有光谱特性的“红边”波段,大幅提高了农业、林业、草原等资源监测能力;北京二号卫星于北京时间2015年7月11日在印度成功发射,轨道高度为651 km。由3颗0.8 m空间分辨率的光学遥感卫星组成,幅宽约24 km,全色波段0.8 m空间分辨率,多光谱为3.2 m空间分辨率。
Sentinel-2携带一个光学仪器有效载荷,包含13个光谱波段,其中:4个10 m空间分辨率波段、6个20 m空间分辨率波段和3个60 m空间分辨率波段,轨道带宽度为290 km,并在红色边缘区域加入了以705 nm、740 nm和783 nm为中心波长的三个新波段,适用于作物物候检测和测绘[14-19]
选择云量较少、质量较好的影像数据,并结合江苏省水稻生长周期[20](表1),避开各地块因播种与收割不同步造成水稻提取误差,并最终确定用于水稻提取的影像,本研究所用卫星影像的时间、空间分辨率等信息如表2所示。
表 1   江苏典型区夏季水稻物候
时间5月6月7月8月9月10月
上旬中旬下旬上旬中旬下旬上旬中旬下旬上旬中旬下旬上旬中旬下旬上旬中旬
播种生长期分蘖生长期开花生长期成熟
表 2   影像相关信息
卫星拍摄时间空间分辨率(m)波段数空间范围
Sentinel-22020.05.23
2020.08.16
2020.09.05
2020.09.20
10、20、6010
(重采样)
1231°30'18.63"N–32°29'38.91"N;
119°6'21.87"E–120°17'47.27"E.
高分系列高分一号2020.06.30多光谱/全色8/2531°32'10.81"N–32°14'52.96"N;
119°31'3.94"E–120°21'30.19"E.
高分六号2020.08.1831°33'37.86"N–32°30'17.31"N;
119°34'1.7"E–120°47'3.72"E.
2020.11.0831°33'14.62"N–32°30′45.44″N;
119°34'18.33"E–120°48'28.38"E.
高分二号2020.08.19多光谱/全色4/131°54'5.56"N–32°9'50.86"N;
119°42'22.56"E–120°2'7.41"E.
2020.10.1731°54'39.86"N–32°9'34.34"N;
119°39'9.43"E–119°57'27.10"E.
北京二号2020.03.05多光谱/全色3.2/0.831°46'48.55"N–31°52'22.52"N;
119°55'40.19"E–120°2'40.93"E.
2020.04.0731°44'41.82"N–31°57'42.36"N;
119°43'16.34"E–119°58'15.08"E.
2020.09.0431°46'46.42"N–31°56'33.09"N;
119°51'59.28"E–120°3'16.13"E.
2020.10.0231°47'7.62"N–31°49'39.07"N;
119°46'11.68"E–119°53'33.49"E.
2020.11.0931°45'57.38"N–31°54'20.78"N;
119°50'57.79"E–120°2'58.15"E.
1.2   数据处理
高分系列卫星数据与北京二号数据均为一级产品数据,首先利用ENVI软件进行正射校正、辐射定标、大气校正以及图像融合处理,并利用ArcGIS软件进行地理配准,结合水稻生长物候信息与实地勘测数据进行常州市新北区孟河镇水稻种植分布真实图制作,以及分类训练样本集与验证样本的绘制。
获取的Sentinel-2数据为二级产品数据,该数据为大气校正后产品,利用SNAP软件进行重采样处理,并进行NDVI、REP指数计算;针对多时相NDVI和REP指数数据集,进行波段组合和数据增强处理;使用多分类器对孟河镇区域影像进行分类处理,针对分类结果进行分类精度评定进行数据集和分类器优选,随后进行大范围长江沿岸(江苏段)水稻种植区提取;经分类后处理,最终预测2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区分布的矢量数据集。详细处理步骤如下:
(1)数据预处理。高分系列数据、北京二号数据依次进行几何校正、辐射定标、大气校正、图像融合,获得高空间分辨率的影像数据,用以进行孟河镇水稻种植区解译。通过SNAP软件针对Sentinel-2的采样工具进行空间分辨率重采样,通过重采样处理,12个波段分辨率均为10 m,便于后续指数计算等处理;
(2)指数计算。利用SNAP软件中植被辐射指数模块计算NDVI、REP指数。计算公式如下:
\(\mathit{NDVI}=\left(NI{R}_{2}-RE{D}_{1}\right)/\left(NI{R}_{2}+RE{D}_{1}\right)\) (1)
\(\mathit{REP}=705+35*\left(\left(RE{D}_{1}+NI{R}_{1}/2-RE{D}_{2}\right)/\left(RE{D}_{3}-RE{D}_{2}\right)\right)\) (2)
式中\(RE{D}_{1}\)表示第四波段,\(RE{D}_{2}\)表示第五波段,\(RE{D}_{3}\)表示第六波段,\(\text{NI}{\text{R}}_{1}\)表示第七波段,\(NI{R}_{2}\)表示第八波段。
(3)指数计算与通道组合。利用ENVI软件将各期NDVI、REP数据分别进行差值处理,并将各时相的两类指数以及对应的差值影像数据进行通道组合。
(4)训练集与验证集制作。结合融合后的高分系列和北京二号数据与实地勘测数据,绘制常州市新北区孟河镇水稻种植区真实分布图。并以此为参考利用ENVI软件随机勾画60个具有典型特征的水稻种植区域地块作为分类训练集样本,将试验区其他水稻种植地块作为验证集样本。验证集样本空间分布如图3所示,共计1332个。


图3   孟河镇水稻种植区验证样本空间分布图
Figure 3 Spatial distribution of validation samples from paddy rice planting areas in Menghe town
(5)图像裁剪与拉伸增强。结合孟河镇区域矢量数据对各项数据集进行裁剪、拉伸增强显示,并叠加孟河镇水稻矢量进行目视判断,进行分类数据集的初步筛选。
(6)数据分类与精度评定。结合步骤(4)中的训练样本集与步骤(5)中目视效果较好的数据集,采用最小距离法、最大似然法、神经网络法和支持向量机法分别进行分类处理。其中神经网络分类算法采用BP(Back Propagation)神经网络,活化函数为对数,迭代次数为100,隐藏层为1,均方根误差值为0.1,权重调节速度为0.2,训练贡献阈值为0.9;SVM核函数为多项式,核心多项式次数为2,偏置为1,gamma为0.333,惩罚参数为100,分级处理等级为0,概率阈值为0。并结合孟河镇水稻种植区验证集数据进行精度评价,包括总体分类精度和kappa系数。
(7)长江沿岸(江苏段)水稻分类。对比步骤6中的孟河镇水稻种植区域不同提取结果的分类精度,进行多时相数据通道组合数据集和分类器的优选,从而进行全局应用[21-22],预测2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区分布情况,并选取5453个水稻种植地块样本进行分类精度评定,验证样本空间分布图如图4所示。


图4   研究区水稻种植区验证样本空间分布图
Figure 4 Spatial distribution of validation samples from paddy rice planting areas in the study area
(8)水稻种植区分布矢量数据集制作。针对全局分类结果数据进行矢量化,利用ArcGIS软件进行矢量面积计算,剔除小面积碎斑区域,最终得到2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区分布矢量结果。
2   数据样本描述
2.1   数据组成
本数据集为2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区矢量数据集。该数据集坐标系为WGS-1984,投影类型为UTM,数据范围为31°30′18.66″N–32°31′9.6″N,119°7′43.9″E–120°15′40.42″E,数据量为139 MB,包括数据库文件、矢量数据、矢量坐标信息等10个文件。
2.2   数据样本
利用ENVI和ARCGIS等软件通过第1章中各步骤处理方法,得到长江沿岸(江苏段)水稻种植区矢量数据集。水稻种植区矢量数据命名格式为:长江沿岸(江苏段)水稻种植区矢量.shp。数据图层展示如图5所示。


图5   长江沿岸(江苏段)水稻种植区分布图
Figure 5 Distribution of paddy rice planting areas along the Yangtze River (Jiangsu section)
3   数据质量控制和评估
针对高分系列、北京二号卫星数据,进行几何校正、辐射定标、大气校正和图像融合处理,并在孟河镇进行实地勘测,确保用于水稻提取的训练样本和精度评定的验证样本的准确性。依据表1中水稻生长周期,进行Sentinel-2影像数据的下载与选取,受天气影响6月与7月影像数据在本次数据集中未使用,对本次实验的水稻生长物候数据连续性有所影响,进而对水稻提取的方法有所局限。同时,受影像空间分辨率限制,小于100 m2的地块无法提取,使得本数据集存在一定误差。
对各数据集分类结果进行4类分类器的精度评价,以5月23日、8月16日与9月5日的REP指数组成的数据集为例,其分类精度如表3所示。
表 3   精度评价表
精度分类器
最小距离最大似然神经网络支持向量机
总体分类精度92.34%92.43%92.73%92.44%
Kappa系数0.700.700.720.71
针对第1.2节中的处理步骤(5)中初步筛选后的数据集,均以孟河镇为小范围试验区进行分类及精度比较,最终选用神经网络分类器进行全局应用,预测大范围的长江沿岸(江苏段)水稻种植区分布结果。针对分类结果在研究内选取均匀分布的5453个水稻种植地块样本作为验证样本进行精度评定,总体分类精度为87.15%。
4   数据价值
目前水稻提取研究主要集中在数据源与提取方法的对比研究,或是针对某一特定小区域范围内的水稻种植区进行研究,展示形式以提取方法的精度对比、小区域水稻分布图、面积统计数据为主等,后续在其他区域较难直接利用。本数据集由多源遥感数据结合实地勘测而得出,覆盖范围广,可实现大范围水稻种植基础信息获取。可用于研究长江沿岸水利与农业生产间的关系,并对于区域、国家粮食产量估算与粮食安全保障具有潜在价值。本数据集为水稻种植区矢量数据,文件数据量小,方便用户了解2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区空间分布等相关信息。
5   数据使用方法和建议
2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区数据集保存为shp格式,可以在ENVI、ArcGIS等相关软件中对数据进行读取、编辑以及统计分析等工作。依据地方农业相关部门需求,掌握水稻种植信息对于制定相关农业计划政策等至关重要,本数据集可以作为长江沿岸以及江苏省水稻种植空间分布、面积变化统计分析、其他年份种植面积对比数据以及水稻产量预估等基础数据。
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数据引用格式
徐慧, 米晓飞, 曹维佳, 等. 2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区数据集[DS/OL]. Science Data Bank, 2023. (2023-09-08). DOI:10.11922/sciencedb.j00001.00350.
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稿件与作者信息
论文引用格式
徐慧, 米晓飞, 曹维佳, 等. 2020年长江沿岸(江苏段)水稻种植区数据集[J/OL]. 中国科学数据, 2023, 8(3). (2023-08-22). DOI: 10.11922/11-6035.noda.2021.0019.zh.
徐慧
XU hui
主要承担工作:基础数据的收集、数据处理、论文撰写。
徐慧(1995—),女,安徽省滁州市人,硕士研究生,研究方向为遥感数据处理与分析。
米晓飞
MI xiaofei
主要承担工作:论文修订与技术校验。
米晓飞(1985—),女,山西省朔州市人,博士研究生,研究方向为遥感分类。
曹维佳
CAO weijia
主要承担工作:总体方案设计、论文修订、数据质量控制。
caowj@aircas.ac.cn
曹维佳(1987—),女,北京人,博士研究生,研究方向为图像处理、机器学习、数据安全。
牟晓莉
MOU xiaoli
主要承担工作:数据汇集和整理,论文编写建议。
牟晓莉(1996—),女,山东省烟台市人,硕士研究生,研究方向为资源环境遥感。
国家对地观测科学数据中心开放基金项目(NODAOP2021011)
Open Fund Project of National Earth Observation Scientific Data Center (NODAOP2021011)
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出版历史
II区出版时间:2023年9月8日 ( 版本ZH3
参考文献列表中查看
中国科学数据
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